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求助,急急急,感谢,如何鉴定混合菌群的每个菌种?

请问大家,如何鉴定混合菌群的每个菌种,就是一群混合菌群,怎么把其中的每株菌都鉴定出来?还有如何测定这一群菌群中的优势菌种以及所占比例?我只知道从一群菌中分离筛选出单个的菌株进行16sRDNA鉴定,但是不知道如何从混合菌群在测出全部的菌株,求大神们指导!
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共14个回答
你说的这些,如果找公司可以做吗?
...
可以的,如果自己不懂这方面,可以问问自己同学,也可以跟靠谱的测序公司沟通,把你的需求告诉他们。
问老板,这个工作可以很简单也可以很难。

利用三代高通量测序技术对于菌株混合物进行16s全长测序。
可以测出来里面都有哪些菌株吗?优势菌是什么?我查文献看到有用fish的,但不太了解

感谢,如果里面还有别的种类呢?
...
古菌?如果古菌发挥功能的比较显著的话可以做古菌群落分析,或者一次性全部做了。引物序列可以咨询测序公司也可以查阅相关文献。
可以的,如果自己不懂这方面,可以问问自己同学,也可以跟靠谱的测序公司沟通,把你的需求告诉他们。...
多谢
可以提取培养物总DNA进行高通量测序,细菌16s,真菌ITS
可以测出来里面都有哪些菌株吗?优势菌是什么?我查文献看到有用fish的,但不太了解
...
注释到种是可以的。菌株的话,应该还不行,毕竟只是用16s全长进行比对。

利用三代高通量测序技术对于菌株混合物进行16s全长测序。
可以提取培养物总DNA进行高通量测序,细菌16s,真菌ITS
感谢,如果里面还有别的种类呢?

做一个宏基因组可以吧,可以把菌群分群,查看每个种树的比例等
你说的这些,如果找公司可以做吗?
...
可以的,如果自己不懂这方面,可以问问自己同学,也可以跟靠谱的测序公司沟通,把你的需求告诉他们。
古菌?如果古菌发挥功能的比较显著的话可以做古菌群落分析,或者一次性全部做了。引物序列可以咨询测序公司也可以查阅相关文献。...
你说的这些,如果找公司可以做吗?

我本科做的跟你有点像,革兰氏染色芽孢染色夹膜染色可以鉴定一批属性不一样的菌,当然要用不同的培养基培养,你发现不一样的菌落就挑出来单克隆,然后检测16srdna,生理生化检测以及发育树的建立,基本能鉴定,不知道对你有没有用

你应该先简单进行分离培养下吧,然后再就行其他筛选!

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