第一,空白溶剂3.5min峰是否每次都一样面积?你能确定样品3.5min的那个峰不是来自溶剂?
建议用DAD看看,紫外行为是否一致;若一致,可能该峰来自溶剂,该方法还能用(但要明确此峰无干扰),否则,色谱条件应重新摸索。
第二,同一个样品溶液是指同一个样品配多瓶溶液,还是配一份在一个进样瓶里反复进样?
若一个样品配多瓶溶液,则需排除污染问题;若一个进样瓶多次进样,2min峰时有时无,则要排除方法不适用的问题。
建议延长进样时间(至少延长5min),或适当增加梯度,看看后面是否还有原方法没出的峰。