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有关PCR的问题求助?

急需PCR大神的帮助,刚刚开始PCR设计了一段简并引物,我的目的条带大小是1500bp左右,可是P出来只有500bp,而且条带也很弱,在100bp那里还有比较粗的条带,但是不是很亮,是不是引物二聚体呢?不知道是什么原因,希望朋友能指点一二,不胜感激。


微信图片_20180731215545.jpg
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共8个回答
一般退火温度设置为50的时候就能跑出目的条带,如果出不来可能就是引物的关系,当然,也有可能是模板浓度过高了,与引物浓度比例不匹配,你可以先将其做个梯度稀释一下。

提高退火温度或降低引物浓度,可改善,如果还不行,只能重新设计引物
说明没p出来

引物没问题的话就是条件合理性问题了,比如GC含量与退火温度,延伸时间,额外体系等

中间那是marker吗?

100bp左右的是引物二聚体,500bp处有条带说明你的引物特异性不够好,有没有用NCBI primer blast确认你的引物对特异性?提高Tm值试一下如果仍然扩增不出来可能需要重新设计引物了。
100bp左右那条很大可能是二聚体了
你重新跑一遍吧

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