引言:
5-溴-2-氯烟酸甲酯是一种重要的有机化合物,其晶体结构展现了复杂而独特的特征。了解其晶体结构特点对于深入研究其化学性质和应用潜力具有重要意义。
简述:
5-溴-2-氯烟酸甲酯,英文名称:Methyl 5-bromo-2-chloronicotinate,CAS:78686-79-0,分子式:C7H5BrClNO2,密度:1.684 g/cm3,沸点:275.6℃,at 760 mmHg,熔点:50-52℃,闪点:120.5℃,折射率:1.568。关于合成 5-溴-2-氯烟酸甲酯的报道较少。合成烟酸盐的一般方法涉及将烟酸与适当的醇或烷化剂反应。5-溴-2-氯烟酸甲酯是合成各种化合物的有用中间体生物活性化合物。
晶体结构分析:
1. 实验
将 5-溴-2-羟基烟酸(0.138 mol)和 N, N-二甲基甲酰胺(0.138 mol)在亚硫酰氯(160 mL)中的溶液回流 2 小时。蒸发亚硫酰氯,将黄色残留物溶解在无水二氯甲烷(200 mL)中,然后逐滴加入无水甲醇。将所得混合物回流 1 小时并蒸发,得到淡黄色油状物,在室温下静置后结晶。通过在室温下缓慢蒸发乙醇溶液一周,获得适合 X 射线衍射分析的晶体。
2. 精炼
所有 H 原子均放置在计算位置,C—H = 0.93 或 0.96 埃米,并使用骑行模型将其纳入最后的精炼循环中,Uiso(H) = 1.2–1.5 倍 Ueq(C)。
3. 结论
化合物 (I) 在非中心对称三斜晶胞中与两个独立分子结晶(如下图)。分子中的键长和键角正常,与之前报告的键长和键角一致(McArdle 等人,1982 年)。两个独立分子中甲氧羰基(C6/C7/O1/O2;C13/C23/O3/O4)和吡啶环平面之间的二面角分别为 45.8 (2) 和 44.0 (3)°。在没有经典分子间相互作用的情况下,晶体堆积表现出相对较短的分子间 Br···O 距离(如下表)。
4. 晶体数据
C7H5BrClNO2
Mr = 250.48
a = 3.978 (2)埃米
b = 8.153 (3) 埃米
c = 14.040 (2) 埃米
α = 96.89 (2)°
β = 96.20 (3)°
γ = 100.70 (2)°
V = 440.2 (3) 埃米3
Z = 2
Mo Kα 辐射
μ = 4.93 mm?1
T = 298 (2) K
0.16 × 0.14 × 0.10 mm
参考:
[1]Ma Y, Liu Y L. Methyl 5-bromo-2-chloropyridine-3-carboxylate[J]. Acta Crystallographica Section E: Structure Reports Online, 2008, 64(6): o1072-o1072.
[2]Kaieda A, Takahashi M, Fukuda H, et al. Structure‐based design, synthesis, and biological evaluation of Imidazo [4, 5‐b] pyridin‐2‐one‐based p38 MAP kinase inhibitors: part 1[J]. ChemMedChem, 2019, 14(10): 1022-1030.