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如何使用琼脂糖凝胶纯化回收试剂盒回收DNA片段? 1

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琼脂糖凝胶纯化回收试剂盒采用DNA硅基质材料和缓冲液系统,可以高效、专一地回收DNA片段。该试剂盒可除去蛋白质、有机化合物、无机盐离子和寡核苷酸引物等杂质,并可回收100bp-10kb大小的片段,回收率大于80%(小于100bp和大于100kb的片段回收率为30-50%)。使用该试剂盒回收的DNA适用于酶切、PCR、测序、文库筛选、连接和转化等常规操作。

使用注意事项

1. 在电泳前最好更换新的电泳缓冲液,以免影响电泳和回收效果。

2. 如果下一步实验要求较高,则应尽量使用TAE电泳缓冲液。

3. 切胶时,紫外照射时间应尽量短,以免对DNA造成损伤。

4. 回收小于100bp和大于100kb的DNA片段时,应加大溶胶液的体积,延长吸附和洗脱的时间。

5. 回收率与初始DNA量和洗脱体积有关,初始量越少、洗脱体积越小,回收率越低。

6. 如非指明,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。

操作步骤

1、琼脂糖凝胶电泳后,将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下(尽量切除多余部分),放入干净的离心管中,称取重量。

2、向胶块中加入3倍体积溶胶液(如果凝胶重为0.1g,其体积可视为100ul,则加入300ul溶胶液),50-55℃水浴放置10min,期间不断温和地上下翻转离心管,以确保胶块充分溶解。注意:溶胶时,如果溶胶液变为红色(正常情况下为淡黄色),可向含有DNA的胶溶液中加入10-30ul3M醋酸钠(pH5.2)将胶溶液调为淡黄色,否则将会影响DNA与吸附柱的结合,影响回收效率。

3、将上一步所得溶液加入一个吸附柱中(吸附柱放入收集管中),12000rpm离心30-60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放入收集管中。注意:胶块完全溶解后最好将胶溶液温度降至室温再上柱,因为吸附柱在较高温度时结合DNA的能力较弱。

4、向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。

5、向吸附柱中加入600ul漂洗液,12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。

6、12000rpm离心2min,尽量除去漂洗液。将吸附柱敞口置于室温或50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,防止漂洗液中的乙醇影响后续的实验。

7、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加适量经65℃水浴预热的洗脱液,室温放置2min,12000rpm离心1min。注意:1)、为了增加回收效率,可将得到的洗脱液重新加入吸附柱中,12000rpm再次离心1min。

2)、洗脱缓冲液体积不应少于30ul,体积过小影响回收效率。3)、洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5之间。

8、DNA产物-20℃保存。

主要参考资料

[1] 琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒说明书

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