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为什么跑western的时候溴酚蓝才跑出胶,小分子的marker就全都没了?

今天跑western的时候,看到溴酚蓝快跑出胶了就停止电泳,但是把胶拿出来一看就发现溴酚蓝上方就直接是40KD的marker,十几二十几的marker全都没有。
我做的流程如下:
按说明书制胶,8.5%的分离胶。
上样量为50ug蛋白,3ul marker(thermo,170KD),两端补齐1Xloading buffer。
90V跑30min,过浓缩胶与分离胶界限后改为120v 30min,由于时间比较紧,后又改为140V 40min,160v跑完。加大电压后将整个电泳槽都置于冰水中。这个方法我以前也用过,跑出来的没什么问题。所以今天突然这样子了,很不解是为什么,而且这样一来我的GAPDH内参也没了……

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共2个回答
可以说几乎90%可以肯定是分离胶浓度的问题,电压加大只是加快了电泳的时间罢了......
8.5%的胶貌似不一定留得住十几KD吧......但是目测可能这块胶的浓度更低
——当然另外10%也可能是Loading Buffer成分的问题
以前这样做的没问题的话,那是不是样品配置的问题。为了排除分离胶的问题,可以重复一下之前的那次
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