生物酶制剂常采用冷冻干燥保存，但保存过程中样品容易受到损伤，如敏感蛋白失活、脂质体失效等，主要是由膜脂质生理状态和敏感蛋白结构改变引起的。为了减少冷冻干燥保存对生物样品的不利影响，可以加入一些保护剂，其中海藻糖的功效最为显著。 肌红蛋白在甘油/水中凝聚很明显，而在海藻糖中凝聚完全被抑制，可能是甘油/水内部粘度很高，血红素“口袋”容易脱水，海藻糖则能防止内部几个关键的水分子脱落，避免内部出现不稳定状态，同时海藻糖能完全抑制肌红蛋白的共价二聚作用。在保存胰岛素时，海藻糖通过隔离分子和限制分子移动可以防止胰岛素凝聚变性。 携带阳离子的脂质体液体条件下保存易聚集失活，加入海藻糖干燥保存的脂质体质量高，可以随时用于检测和转化，实验证明脂质体保存在0.5mol海藻糖中，转化率与新制备的相似。脂质体干燥和水化时易出现裂缝，内含物泄漏到培养基，脂质体就会失效，用海藻糖干燥则可避免内含物泄漏，因为海藻糖代替脂质分子头部基团间的水分子，降低于膜的相变温度，防止重新水化时脂质状态转换及伴随出现的裂缝。从龙虾基质网分离的囊泡不加海藻糖干燥会发生融合和ca2+转运能力全部丧失，用海藻糖干燥可消除这些不良影响。
