电泳核酸需经染色才能显色带型用核酸染色剂：
1、溴化乙锭（ethidium bromide, EB）
用核酸荧光染料嵌入核酸双链配碱基间紫外线激发发桔红色荧光 EB-DNA复合物EB发荧光比游离凝胶EB发荧光强度10倍需洗净背景即清楚观察核酸带型若EB背景太深凝胶 浸泡于1mmol/LMgSO41h或10mmol/L MgCl25min使非结合EB褪色 检查10ngDNA品EB用于检测单链DNA或RNA其单链核酸亲力相较荧光产率相较低
凝胶或电泳缓冲液加入终浓度0.5μg/mlEB染色电泳程进行能随观察核酸迁移情况EB带电荷嵌入碱基增加 核酸刚性使迁移率减慢故宜用于测定核酸量应电泳凝胶浸入0.5μg/mlEB水溶液10min进行染色EB见光 易解应于4℃避光保存
2、吖啶橙（acridine orange, AO）：
吖啶橙嵌入双链核酸碱基间254nm紫外线激发发530nm绿色荧光；通静电与单链核酸磷酸基结合254nm紫外线激发 产640nm红色荧光区单链双链核酸灵敏度别0.1μg0.05μg吖啶橙染色操作要求严格应 22℃0.01mol/L磷酸钠缓冲液（pH7.0）避光浸泡30min搪瓷盘用该缓冲剂4℃脱色夜或22℃脱色1~2
3、银（Ag+）试剂：
Ag+与核酸形稳定复合物用甲醛使Ag+原银颗粒AgNO3等试剂使聚丙烯酰胺凝胶单链双链DNA及 RNA都染黑褐色银染灵敏度比EB染色高200倍左右比亚甲蓝染色高100~1000倍于0.5mm厚凝胶能检测0.5ng RNA其缺点专性强能与蛋白质污剂反应产褐色且DNA染色定量准确银与DNA稳定结合DNA破坏作用适于DNA 片段收制备
4、亚甲蓝（methylene blue）
RNA染蓝色灵敏度高且操作间染色程：胶浸泡于0.02%亚甲蓝10mmol/L Tris-Ac（pH8.3）4℃放置1~2h用净水洗5~8h（反复换水）带型肉眼见低检测量 250ng
