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请问如何用RT-PCR的方法怎么检测p38,JNK,ERK通路?

请问如何用RT-PCR的方法怎么检测p38,JNK,ERK通路?不知道这么作是不是可以,如果可以,应该检测哪一方面?

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共8个回答
我感觉,研究信号通路的分子,观察其活性状态的改变很重要,普通的PCR可能难以做到,通常这些分子的改变主要体现在磷酸化和去磷酸化之间的转化,真正表达水平的改变比较少,太耗时了。
当然可以,你需要先设计引物,专门有设计软件,如primer5,DNA man,第一步,提取RNA,然后合成cDNA,最后PCR。你也可以查文献,用别人用过的引物,这样可靠。RT-PCR要注意RNA酶,RNA很容易降解,不过合成cDNA后,就安全了。如果要定量,最好选一个内参照。
最近读了很多文献,均未发现有使用RT-PCR的方法怎么检测p38,JNK,ERK通路的报道。常使用的方法有:免疫沉淀法;Western Blot;ELISA等方法。还有一些和大家一起学习!
我劝你还是好好看看怎么用Western blot的方法来检测p38吧,最好选用Sigma公司的,因为我也是做p38的。开始的时候,想法和你一样,一直想用RT-PCR的方法,因为我当时跟我师兄学的就是这个,所以不想改了,但是经过查阅大量的资料发现基本上都是用的Western blot,当然也有免疫沉淀等其他的方法,那些都是少数,最多的还是用的Western。不用妄想着做RT了,光是设计引物这一条就够受的,现在的好多公司设计的都不可靠,一些老师自己会设计,但是不敢保证起可靠性。我的一个同学当时设计引物时专门请的人帮忙,最后目的基因也出来了,跑胶的时候位置也是在那个位置,但是最后经过测序后发现根本就不是!我经过这件事就下定了决心:拿不准注意的就用已经成熟的方法!话可能有点难听,但是希望你及早定下决心
 总p38,JNK,ERK水平在细胞内不会有什么明显的改变 只有磷酸化的p38,JNK,ERK水平才是有活性并起重要作用 对这些蛋白的研究必然要检测其磷酸化水平 可以有免疫组化和western blot 我看RT-PCR检测在这方面没有太大的用处
目前对信号传导没有单一的确证性方法。mRNA水平的变化可以作为转录水平调控下游目的基因的参考,当然观察转录水平的调控还有其他的方法,如报告基因。对蛋白水平的变化也不要过分迷信,蛋白水平的变化有可能只是此种蛋白的风度高,提取的效率更高,在提取物中更稳定,或者更适用于免疫印迹的实验条件。即便蛋白水平有变化,也无法直接说明就存在因果联系。
RNA和蛋白质的量是不平行的,有很大差异。建议你还是用电泳吧!不麻烦,细心点就是了。
用RT的方法根本行不通。首先不说RNA水平有没有明显变化,单RT来说现在大家也不太接受它的可信度,可以说你想作出什么结果都可以。其次,MAPK途径是通过一系列的磷酸化来调节下游基因表达。p38, JNK, ERK在细胞中的表达总量一般变化不大,但并不是这些蛋白都有活性。只有当MEK1,MEKK1等上游激酶把他们磷酸化以后,磷酸化的p38,JNK,ERK才有活性调节下游基因。如果你用RT或者Northern检查RNA水平的表达,那么一般不会有变化,即使你用普通的抗体检测上述3个基因的表达都不会有什么变化,只有用他们的磷酸化抗体检测才能看到他们的变化。很多文章里面都会用普通抗体证明蛋白水平的表达没有变化,然后用磷酸化抗体证明他们的活性变化。不过抗体比较贵,看看你们老板是不是有足够的米米了。
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