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DNA甲基化的重要性及检测方法? 1

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DNA甲基化是一种通过DNA甲基化酶修饰DNA分子碱基上的甲基基团的过程。甲基化后的特定碱基不再受限制性内切酶切割。DNA甲基化在维持细胞功能、传递基因组印记、胚胎发育和肿瘤发生等方面起着重要作用。蛋白质富集全基因组甲基化测序(MBD-Seq)是一种检测DNA甲基化的方法,通过甲基化DNA富集和高通量测序来检测全基因组范围内的甲基化位点。

如何进行DNA甲基化测序

技术参数

服务名称

服务名称

服务名称

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MBD-seq

MBD-seq

MBD-seq

MBD-seq

样品要求

1) 样品质量:OD 260/280值应在1.8~2.0之间,无RNA污染,无降解。

2) 样品浓度:最低浓度不低于50ng/μl。

3) 样品总量:每个样品总量不少于15μg。

4) 样品溶剂:要溶解在无菌的10 mM TirsHCl,1mM EDTAE (pH 8.0)溶液中,经过65°C 10分钟处理。

5) 样品运输:DNA低温运输(-20℃),在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染。

应用

非小细胞肺癌(NSCLC)是一个复杂的恶性肿瘤,DNA甲基化是其预后和治疗的重要机制。研究者采用了NSCLC样本和对照组肺组织进行全基因组DNA甲基化分析,结合MethylCap和高通量测序(MBD-seq),以提供全面的肿瘤和对照组肺标本的DNA甲基化图谱。结果表明,重复实验内及实验组和对照组间的MethylCap-Seq数据均显示很强的正相关性。

参考文献

[1] 英汉互查肿瘤学词汇

[2] MBD甲基化测序技术说明书

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