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Fmoc-(2-氯苄氧基羰基)赖氨酸有哪些潜在应用? 1

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引言:

N-Fmoc-N'-三苯甲基-D-天冬酰胺在固相肽合成中具有重要应用,能够用于合成具有特定序列的肽分子。此外,它还可以在药物开发和生物材料研究中,作为关键中间体优化肽链的构建过程。


简介:

N-Fmoc-N'-三苯甲基-D-天冬酰胺Fmoc-D-Asn(Trt)-OH),别名是N-芴甲氧羰基-N'-三苯甲基-D-天冬酰胺,是一种化学物质,分子式是C38H32N2O5。其化学式C38H32N2O5,分子量596.67,CAS登录号180570-71-2。通过 Fmoc SPPS 引入 D-天冬酰胺氨基酸残基的标准构建块。N-Fmoc-N'-三苯甲基-D-天冬酰胺是一种在肽合成中广泛使用的试剂。它有效抑制了酰胺侧链在活化过程中发生脱水副反应的风险,特别是在使用碳二亚胺试剂时。此外,该化合物能够在所有常用的肽合成试剂中迅速溶解。N-Fmoc-N'-三苯甲基-D-天冬酰胺的结构如下:


研究应用:
1. 固相肽合成

N-Fmoc-N'-三苯甲基-D-天冬酰胺是固相肽合成(SPPS)中的重要试剂,该技术是肽化学的核心,能够合成具有特定氨基酸序列的肽。N-Fmoc-N'-三苯甲基-D-天冬酰胺在肽链延伸中提供了D-天冬酰胺(Asn)残基,其中的“三苯甲基”基团(Trt)在合成过程中保护Asn残基的侧链,使其能够选择性地去保护并与其他氨基酸反应形成肽键。


2. 杆菌肽A的合成

Jinho Leednegr 报道了一种高效的固相法用于杆菌肽A的全合成。开展这项工作是为了提供一种通用方法,以探索杆菌肽的有趣作用方式,并探索它们用于对抗新出现的耐药病原体的潜力。杆菌肽 A 的合成方法涉及三个关键特征:(1) 通过 L-天冬酰胺基残基在 12 位 (L-Asn(12)) 的侧链与固体载体连接),(2) 通过在 L-Asn 的 α-羧基 (12) 和 L-Lys 的侧链氨基 (8) 之间形成酰胺键进行环化,以及 (3) N-末端噻唑啉二肽作为单个单元的环化添加。为了启动合成,将Fmoc L-Asp(OH)-OAllyl连接到PAL树脂上。通过序贯哌啶脱保护/HBTU介导的与Fmoc D-Asp(OtBu)-OH、Fmoc L-His(Trt)-OH、Fmoc D-Phe-OH、Fmoc L-Ile-OH、Fmoc D-Orn(Boc)-OH、Fmoc L-Lys(Aloc)-OH、Fmoc L-Ile-OH、Fmoc D-Glu(OtBu)-OH和Fmoc L-Leu-OH的偶联循环,在C-to-N方向上阐述了杆菌肽A的链。


3. 肽合成效率

Fmoc-D-Asn(Trt)-OH已与肽合成中的其他衍生物进行了比较,显示出不同的效率水平。肽合成的多引脚方法被证明是一种有效的方法学工具,可以同时进行大量的比较研究。A. M. Bray等人介绍了两项研究。在每项研究中,同时合成测试肽,并通过高通量离子喷雾质谱法和反相 HPLC 检查产物。第一项研究包括24个实验,使用Fmoc-Axx/BOP/HOBt/NMM(100:100:100:150 mM)和Fmoc-Axx/HATU/HOAt/NMM(100:100:100:150 mM)制备肽1(AELFSTHYLAFKEDYSQ-NH2)和2(LKDFRVYFREGRDQLWKGPG-NH2),偶联时间为60.90和120 min。发现两种试剂组合的结果相当。第二项研究比较了Fmoc-Asn-OH、Fmoc-Asn(Mbh)-OH、Fmoc-Asn(Mtt)-OH、Fmoc-Asn(Tmob)-OH和Fmoc-Asn(Trt)-OH在7种测试肽合成中的N端偶联:3,NVQAAIDYIG-cyclo(Kp);4、NTVQAAIDYIG-cyclo(KF);5、NRVYVHPFNL;6、NRVYVHPFHL:7、NEAYVHDAPVRSLN:8、NQLVVPSEGLYLIYSQVLFK。9, NPNANPNANPNA.共进行了33个实验。选择肽 3 和 4 来突出每种 Asn 衍生物的空间体积对偶联效率的影响。通过靶肽纯度测量的试剂效率如下:Fmoc-Asn(Tmob)-OH>Fmoc-Asn-OH> Fmoc-Asn(Mtt)-OH = Fmoc-Asn(Trt)-OH>Fmoc-Asn(Mbh)-OH。


4. 肽中天冬酰胺的形成

天冬酰胺及其在-Asp-Asn-之间形成的哌啶加合物是在基于Fmoc的凝血因子中合成EGF样结构域的过程中发现的。Yan Yang等人对7种敏感-Asp-X-五肽的模型研究表明,-Asp(Ot-Bu)-Asn(Trt)-和-Asp(Ot-Bu)-Gly-是最成问题的序列。


参考:

[1]Bray A M, Valerio R M, Dipasquale A J, et al. Multiple synthesis by the multipin method as a methodological tool[J]. Journal of Peptide Science: An Official Publication of the European Peptide Society, 1995, 1(1): 80-87.

[2]Yang Y, Sweeney W V, Schneider K, et al. Aspartimide formation in base-driven 9-fluorenylmethoxycarbonyl chemistry[J]. Tetrahedron letters, 1994, 35(52): 9689-9692.

[3]Lee J, Griffin J H, Nicas T I. Solid-phase total synthesis of bacitracin A[J]. The Journal of organic chemistry, 1996, 61(12): 3983-3986.

[4]Shapiro G, Büchler D, Dalvit C, et al. Combined Fmoc-Alloc strategy for a general solid phase synthesis of phosphoserine peptides[J]. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 1996, 6(4): 409-414.

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