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ANTI-SF1抗体的应用及解旋酶的分类? 1

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背景[1-3]

ANTI-SF1是一种多克隆抗体,能够特异性结合SF1。该抗体广泛应用于免疫学实验,包括Western Blot、IHC-P、IF、ELISA、Co-IP等。

检测原理:采用双抗体夹心法检测SF1水平。首先,在微孔板上包被纯化的SF1抗体,形成固相抗体。然后,依次加入SF1样品和HRP标记的SF1抗体,形成抗体-抗原-酶标抗体复合物。经过洗涤后,加入底物TMB进行显色。TMB在HRP酶的催化下转化成蓝色,最终转化成黄色。颜色的深浅与样品中的SF1浓度正相关。通过酶标仪在450nm波长下测定吸光度(OD值),根据标准曲线计算样品中SF1的浓度。

解旋酶是一类重要的酶,几乎参与所有涉及DNA或RNA的生物过程。解旋酶的功能缺陷和蛋白质表达失控与许多疾病有关,如癌症、发育缺陷和神经退行性疾病。解旋酶可分为环状为主的六面体结构和未形成环的酶两类。其中,环状结构由SF3至6组成,未形成环的酶由SF1和2组成。本文将根据不同的蛋白质家族对解旋酶进行分类,以补充和扩展现有的SF1和SF2解旋酶分类。

应用[4][5]

胡麻枯萎病生防菌SF1生防功能基因的预测研究

本研究以实验室分离得到的萎缩芽孢杆菌SF1为研究对象。首先,对菌株SF1的生长特性进行了测定。其次,测定了菌株SF1对不同省份分离的胡麻枯萎病病原菌的抑制效果。最后,对菌株SF1的全基因组序列进行了测定和解析,并筛选出潜在的生防基因。

研究结果如下:1、绘制了菌株SF1的种子生长曲线和发酵生长曲线。确定了种子培养条件和发酵培养条件。

2、通过Illumina MiSeq测序平台对菌株SF1的全基因组序列进行了测定和解析。结果显示菌株SF1基因组大小为4,143,714bp,编码蛋白质的序列占全部基因组的87.2%。克隆获得了β-1,3-葡聚糖酶基因,与Bacillus atrophaeus UCMB-5137的yhfE基因相似性为95%,证明全基因组测序结果可靠。

3、通过蛋白比对注释发现,SF1基因组中含有多种抗生素的基因簇,包括核糖体合成的细菌素和抗菌酶类。同时还发现非核糖体合成的抗菌脂肽类物质和菌溶素,以及儿茶酚型嗜铁素铁载体和与定植密切相关的基因。

参考文献

[1]Lipopeptide surfactants:Production,recovery and pore forming capacity[J].Mnif Inès,Ghribi Dhouha.Peptides.2015

[2]Enhanced production of antifungal lipopeptides by Bacillus amyloliquefaciens for biocontrol of postharvest disease[J].D.Pretorius,J.van Rooyen,K.G.Clarke.New BIOTECHNOLOGY.2015(2)

[3]Chemical and genetic characterization of bacteriocins:antimicrobial peptides for food safety[J].Abigail B Snyder,Randy W Worobo.J.Sci.Food Agric..2014(1)

[4]Lipopeptides,a novel protein,and volatile compounds contribute to the antifungal activity of the biocontrol agent Bacillus atrophaeus CAB-1[J].Xiaoyun Zhang,Baoqing Li,Ye Wang,Qinggang Guo,Xiuyun Lu,Shezeng Li,Ping Ma.Applied Microbiology and Biotechnology.2013(21)

[5]谢慧敏.胡麻枯萎病生防菌SF1生防功能基因的预测[D].内蒙古大学,2016.

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