改造载体构建？

科研小白，进实验室两个月，导师让我改造一个载体，将一个载体上的基因插入另一个载体上。自己查资料，学姐指导，从找酶切位点，设计引物，酶切回收，连接载体和片段，转化，菌落PCR/F8验证一步一步，最后到用原来的酶再酶切验证的时候，却只切出一条带，两条带的位置也不正确，学姐说是假阳性，我从连接开始重做，反复做了好几遍，改变载体和片段连接的比例，时间，最后酶切验证的结果都是一样的，真的很失落，过年也没回家，就在实验室构建这个载体，结果却不如人意，求各位大神指点，帮帮我吧。