肠巨噬细胞是免疫细胞中的一种重要成员,具有多种功能。它们是研究细胞吞噬、细胞免疫和分子免疫学的关键对象。与其他免疫细胞相比,肠巨噬细胞的获取和培养相对容易,并且可以进行纯化。虽然肠巨噬细胞属于不繁殖细胞群,但在适宜的条件下可以生存2-3周,常用于原代培养。
肠巨噬细胞和单核细胞都是吞噬细胞,参与脊椎动物体内的非特异性防卫和特异性防卫。它们的主要功能是吞噬和消化细胞残片及病原体,并激活淋巴球和其他免疫细胞对病原体作出反应。肠巨噬细胞在肠道中起到重要的防御作用。
本研究旨在分析长链非编码RNA(lncRNA)在脂多糖刺激的大鼠肠巨噬细胞组与未处理组之间的差异表达谱,并对差异表达的mRNA进行生物信息学分析,以初步探讨lncRNA的调控机制。
研究方法如下:
1. 提取六只大鼠的肠巨噬细胞进行培养,随机分成两组。实验组加入浓度为1 mg/L的脂多糖诱导肠巨噬细胞,对照组则不加脂多糖。使用高通量基因芯片技术检测两组之间差异表达的lncRNA和mRNA,并通过分层聚类方法进行分析。
2. 对差异表达的mRNA进行基因功能分析和信号通路分析,探索其参与的生物学功能,并构建差异表达lncRNA和mRNA的共表达网络,以发现核心调控地位的lncRNA。
3. 结合共表达网络分析结果和基因芯片数据,选择差异表达的lncRNA和mRNA进行实时荧光定量PCR技术验证。
研究结果显示,与对照组相比,经过脂多糖处理的肠巨噬细胞组的lncRNA和mRNA表达谱发生明显变化。共有357个lncRNA差异表达,其中245个上调,112个下调。共有542个mRNA差异表达,其中187个上调,355个下调。
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