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载体构建一直切出来的都是空质粒?

用的是pET22b(+),大小是5493bp,目的片段是936bp。采用的是内切酶BamH I和Nde I,大概操作如下:

PCR获得目的片段后,利用质体提取试剂盒提取质粒,然后分别双酶切,并设置酶切对照,电泳验证酶切完全,之后是胶回收,利用T4 DNA ligase连接,质粒与目的片段大概是1:4~1:8比例加入,然后16℃连接过夜,第二天做感受态,采用的是CaCl2法转化,并设置阴性对照(感受态直接转化涂布抗性平板)和阳性对照(空质粒转化抗性平板),平板过夜培养后,阴性对照无菌落,阳性对照长满整个平板,说明感受态制备较好,抗性平板也具备筛选能力,实验组菌落分布也比较均匀,长的有七八十个单菌落,但是提取质粒验证均与空质粒大小一致,见图。

起初以为是双酶切效果不好,也做了两步单酶切。但是也没有连上。将原来已经构建好的质粒(我要做的是对其中一个氨基酸进行突变,所以有野生型构建好的质粒)经酶切后,再胶回收连接,转化提取结果仍是空质粒。大家给分析一下 是什么原因?


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在pET22b中BamH I和Nde I之间有多少碱基对? 在你的凝胶图片中,4号线的消化是什么? 泳道1,3和6-10中的质粒似乎未切割。 
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