4-氨基-2-甲巯基嘧啶-5-甲醛是医药和农药的重要中间体，也是广泛应用于有机合成的中间体。PamapimodR1487和其他p38丝裂原活化蛋白激酶抑制剂的合成中都需要使用4-氨基-2-甲巯基嘧啶-5-甲醛，此外，许多药物分子和有机合成中也常常使用该中间体。
下面是一种合成4-氨基-2-甲巯基嘧啶-5-甲醛的方法：
(1) 取0.15-0.25mol氰基乙醛缩二乙醇或氰基乙醛缩二甲醇，用四氢呋喃溶解，在温度10-20°C下加入0.20-0.30mol甲醇钠，于10-20°C下搅拌反应1-2小时；保温，缓慢滴加含有0.20-0.30mol甲酸甲酯的四氢呋喃溶液50ml，滴毕后在10-20°C下搅拌反应5-7小时；
(2) 上述反应后，所得混合物降温至10-20°C，然后缓慢加入0.20-0.25mol甲醇钠，升温至60-70°C，缓慢滴加0.15-0.25mol2-甲基-2-巯基硫酸脲，滴毕后在60-70°C下反应4-6小时；反应后，减压移除溶剂，然后向反应体系中加入80-120mL乙醇与水的混合物，10-20°C下搅拌40-80分钟后抽滤，收集得浅黄色固体，用乙醇与水的混合物洗涤一次后，再用水洗涤一次或两次，干燥后得浅黄色晶体，即为4-氨基-2-甲巯基嘧啶-5-甲醛；
所述乙醇与水的混合物中，乙醇与水的体积比为1:5。
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