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如何进行平末端DNA加A尾以便进行TA克隆? 1

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背景[1]

高保真PCR酶利用自身的3’→5’外切酶活性(pfu DNA Polymerase,PrimeSTAR HS DNA Polymerase等)能保证PCR产物的保真度,但扩增的PCR产物为不带A尾的平末端DNA片段,不能直接TA克隆。因此,平末端DNA片段需要进行加A后方可TA克隆。平末端DNA加A的步骤一般是先纯化PCR产物,加入dATP Buffer利用Taq DNA polymerase在平末端片段后加上A尾后才能与T载体的T头互补连接TA克隆。步骤较为烦锁,要购买特定的dATP Buffer。经过优化后的A-Tailing Enzyme可以有效地将dAMP掺入平末端DNA片段的3′端。3′-dA DNA产物在随后的连接步骤中可防止相互形成多聚体。

应用[2]

加A尾的DNA连接到具有互补dT突出端的连接子或克隆载体上。

用A-Tailing Enzyme模块加A尾的DNA可以连接到具有互补dT突出端的连接子或克隆载体上。

方法改进:平末端DNA片段加A方法根据实验者的技能程度推荐两种方法:

(1)保守法,先对平末端PCR产物纯化后,浓度要求至少20ng/ ul(大概就好,跑胶图像条带清晰,明亮),取14.5 ul PCR产物,加入2 ul Taq Buffer,3ul dNTP,0.5 ul Taq酶,在72度反应10~20min, 后直接回收纯化加A尾的DNA片段可用于TA克隆,此方法操作容易,成功率高;

(2)快速法,高保真酶PCR后的管子(体系为50ul)不用先纯化直接加入3ul dNTP 和0.5 ul Taq酶继续72度反应10~20min,此后直接回收或跑胶回收纯化加A尾的DNA片段可用于TA克隆,此方法操作步骤较少和方便,节省实验时间和实验经费。

结果:推荐的两种方法均能使平末端DNA片段加A尾,方便TA克隆。另外,使用dNTP 代替dATP,节省实验经费。

参考文献

[1] 末端加A酶产品介绍

[2]生物通

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