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什么是新物种均一化cDNA文库测序? 1

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新物种均一化cDNA文库测序是一种有效的方法,用于克服基因转录水平上的巨大差异,以便进行文库筛选和分析。它有助于研究基因的表达和序列分析。近年来,均一化cDNA文库已成为获得EsT和发现基因的有效平台。它可以降低文库中高丰度的CDNA,为随机序列和稀有基因的发现提供条件。研究数据表明,大多数基因转录产物在单个细胞中的拷贝数为1-15个,属于中等或低等表达丰度。然而,个别高丰度表达基因在单个细胞中的转录产物可达500个拷贝左右,约占总表达量的25%。这种基因表达能力引起的巨大差异使得获取具有完整代表性CDNA文库变得困难,从而使大规模研究变得困难。高拷贝基因序列的存在也为功能基因的筛选和鉴定带来了不必要的浪费。

为了克服这些障碍,新物种均一化cDNA文库测序采用了不同的均一化方法,包括饱和杂交均一化法、寡核昔酸序列指纹均一化法、复性式均一化法和双链特异性核酸酶均一化法。其中,基于双链特异性核酸酶(Duplex-SpecificNuclease,DSN)的先进cDNA文库均一化技术能够将高丰度表达基因减少100倍以上,有效富集低丰度表达基因,从而降低冗余率。

主要参考资料

[1] 全长均一化cDNA文库及其应用

 

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