重组酶酶活测定？

使用pGEX-4T-1载体与我的目的基因重组，在大肠BL21中表达我的酶，破碎后去上清，测酶活，现象非常奇怪，上清与底物混合后不用反应就可以得到产物，而且灭活组是没有的，跑了SDS-PAGE在目的区太多杂蛋白无法区分，想问问大家这个上清中有没有可以某种物质可以与我的底物反应，而不是蛋白同时又可以降解我的底物