一般确认凋亡都会用至少两种染色方法确认的。因为有时候会有假阳性（细胞处于非凋亡状态的时候也可能被出现细胞质固缩，被染色），或者细胞处于凋亡早期，用hoeches染色方法（检测凋亡中晚期）检测不到。
一般早期凋亡是检测caspases以及相关蛋白活性的，如caspase-3 activity assay, M30 cyto Death， anti-PARP;
检测细胞膜翻转（PS)的：Annexin-V/PI双染色法
检测DNA片段：TUNEL试剂盒（AP,POD,Flu,TMR red) CEll death detection kit-ELISA;
不过用于组织切片的，好像比较常用的是BIODAI的TUNEL, 罗氏的M30 CytoDeath检测caspase裂解ck-18后的产物的，特异性很高，但是用的人就远没有TUNEL的多了。
