简化基因组测序(Reduced-Representation Genome Sequencing, RRGS)是一种通过限制性内切酶切开基因组DNA，对指定部分采用高通量测序的方法。通过这种方法，可以得到大量遗传多态性标签序列，从而展现物种全基因组的测序对策。简化基因组测序可以减少基因组的复杂度，使实施过程简便，费用少，同时不依靠参考基因组也能得到全基因组中的遗传多态性标签。因此，该技术在基因学和进化学中得到广泛应用。
简化基因组测序(RRGS)能够大幅降低基因组的复杂度，显著降低测序成本，并快速鉴定高密度的SNP位点。因此，它常被用于遗传变异检测、高密度遗传图谱构建、重要性状候选基因定位和群体遗传进化分析。在动物基因组研究中，常用的简化基因组测序技术包括简化代表文库测序(RRLS)和限制性酶切位点关联DNA测序(RAD-seq)。
简化基因组测序能够获得全基因组范围内有代表性的遗传多样性位点，因此广泛应用于群体进化、群体结构、种群历史、遗传定位和连锁图谱的构建。
[1] 胡亚亚，刘兰服，冀红柳，韩美坤，焦伟静，高志远，马志民.简化基因组测序技术研究进展。江苏师范大学学报(自然科学版)。
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