有机化合物的晶体在熔融时并不直接变为液体，而是经过一个或两个中间过渡，这种过渡态从某一个方向看时，分子排列较整齐而有一定结构形态；但从另一方向看时，分子又是杂乱而没有固定的结构。在中间过渡态时，它既具有液体的流动性，又具有晶体的光学特性，故称为液晶。
液晶态的物质其分子排列可分为三种类型：（1）近晶型一一分子排列平行而成层，（2）向列型一分子排列平行但不成层，（3）胆甾型一一分子排列呈螺旋型结构。
这些液晶由于其“薄膜”、“定向”的效应，对于能适合其分子结构形状的溶质分子有特殊的溶解度。利用这种特性，许多难分离的不同分子形状的位置异构物，尤其是某些空间异构物，能够得到很好的分离效果。例如，对位的二取代苯是线形结构，易于和液晶的平行定位相合，其保留值就较有位阻的间位异构物大，从而使二者得以分离。
ρ－苯二（ρ—庚氧基苯甲酸酯）除了各种位置异构物外，还能分离有些空间异构物，例如:（粗线表示向外，细线表示向里的键）．这对异构物用其它固定液是从未能分离过的．液晶做为固定相，其缺点是柱容量小，以及由于柱温必须保持在液晶相温度范围内，以致高沸点化合物的保留时间过长。
有机皂土常被应用于二甲苯异构物的分离，对于其它位置异构物也有较好的效果。
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