在获得一个基因序列后，需要进行生物信息学分析，以发掘其中的信息并指导进一步的实验研究。基因序列分析可以通过多种方法，如染色体定位分析、内含子／外显子分析、ORF分析、表达谱分析等，来阐明基因的基本信息。此外，通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等方法，可以识别调控区的顺式作用元件，为基因的调控研究提供基础。另外，通过蛋白质基本性质分析、疏水性分析、跨膜区预测、信号肽预测、亚细胞定位预测和抗原性位点预测等方法，可以对基因编码蛋白的性质进行初步判断和预测。特别是通过疏水性分析和跨膜区预测，可以预测基因是否为膜蛋白，从而对实验研究方向的确定具有重要参考意义。
通过对H9N2亚型禽流感病毒分离毒株的HA基因进行同源性、遗传进化和基因序列分析，为我国H9N2亚型禽流感病毒的遗传进化提供了数据。通过继续流感病毒的监测和研究，可以为该亚型禽流感的防控和疫苗研制提供参考依据。
[1]陈朗，彭乔烽，刘云红，郑天宇，朱乔峰，刘丽霞。奶牛DQA2基因序列特征分析。图分类号：S823.3 文献标识码：A 文章编号：1004-4264（2019）06-0001-05
[2]杨志远,林健,王小蕾,刘立新,赵际成,潘洁,刘月焕,段会娟。一株H9N亚型禽流感病毒的鉴定与HA基因序列分析。动物医学进展,2019 ,40 (9):13-18
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