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预测一种蛋白序列(aa序列,mRNA序列)上是否有定位到线粒体上的信号肽,有什么途径?

请教:

(1)信号肽是不是可以根据它将蛋白引导到的靶位点分很多种类(比如: 运送到各种细胞器,细胞核,胞外空间)?这些信号肽的序列相差是不是很大?

(2)我想预测一种蛋白序列(aa序列,mRNA序列)上是否有定位到线粒体上的信号肽,有什么途径?(比如生物信息学方法预测等)


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一些典型的分选信号,输入细胞核,-Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val-,输出细胞核;-Leu-Ala-Leu-Lys-Leu-Ala-Gly-Leu-Asp-Ile-,输入线粒体:+H3N-Met-Leu-Ser-Leu-Arg-Gln-Ser-Ile-Arg-Phe-Phe-Lys-Pro-Ala-Thr-Arg-Thr-Leu-Cys-Ser-Ser-Arg-Tyr-Leu-Leu-输入质体+H3N-Met-Val-Ala-Met-Ala-Met-Ala-Ser-Leu-Gln-Ser-Ser-Met-Ser-Ser-Leu-Ser-Leu-Ser-Ser-Asn-Ser-Phe-Leu- Gly-Gln-Pro-Leu-Ser-Pro-Ile-Thr-Leu-Ser-Pro-Phe-Leu- Gln-Gly-输入过氧化物酶体-Ser-Lys-Leu-COO-输入内质网+H3N-Met-Met-Ser-Phe-Val-Ser-Leu-Leu-Leu-Val-Gly-Ile-Leu-Phe-Trp-Ala-Thr-Glu-Ala-Glu-Gln-Leu-Thr-Lys-Cys- Glu-Val-Phe-Gln-返回内质网:-Lys-Asp-Glu-Leu-COO-(KDEL)由质膜到内体:Tyr-X-X-Φ每一种信号序列决定特殊的蛋白质转运方向,如输入内质网的蛋白质通常N端具有一段信号序列,含有6-15个带正电荷的非极性氨基酸。由高尔基体返回内质网的蛋白质,其C端的四个氨基序列。目前对于信号斑了解较少,主要是因为它存在于复杂的三维结构中,很难将其分离出来研究。
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