ChIRP技术的原理和应用？ ¹

ChIRP（Chromatin Isolation by RNA Purification）是一种用于研究RNA与DNA、RNA及蛋白质相互作用的实验技术。通过设计生物素探针组，ChIRP技术可以将目标RNA特异性拉下，并富集与其互作的DNA、RNA或蛋白质。通过高通量测序或PCR，可以得到调控RNA转录调控的下游靶基因。同时，ChIRP技术还可以通过Western Blot验证或者质谱鉴定与目标RNA结合的蛋白质。

ChIRP技术利用生物素标记探针识别靶RNA，并将与其结合的蛋白一并纯化出来。生物素与链霉亲和素之间的作用是已知强度最高的非共价作用，因此ChIRP技术具有高特异性和高灵敏性。

ChIRP试剂盒提供了实验所需的缓冲液和试剂，操作简单方便。试剂盒中还提供了阴阳性对照，确保实验结果准确。实验获得的染色质可以使用多种方法进行检测，如RT-qPCR、qPCR和二代测序等。

ChIRP技术的应用

ChIRP试剂盒可用于验证和筛选RNA结合蛋白在体内条件下的作用。例如，可以使用ChIRP技术分离和鉴定与多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合的蛋白。通过高效液相色谱-质谱法和ChIRP剂盒的组合应用，可以筛选出与Oct4 RNA结合的候选蛋白，并进一步验证其功能。

参考文献

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