虫草类的真菌并不是一种，而是多种真菌共生的结果，包括了虫草科、线虫草科、麦角菌科等科的真菌，国际真菌名录数据库列出的种名已有540个。正是由于真菌来源的不同，才形成了不同类型、丰富多样的虫草资源。
从现实应用来看，研究较深入、开发性高的虫草资源主要有冬虫夏草、蛹虫草、蝉花和广东虫草四类。
冬虫夏草是冬虫夏草菌寄生在蝙蝠蛾科昆虫幼虫上的子座及幼虫尸体的干燥复合体，其在分类上一直存在争议。通常以中国植物志记载的唇形科水苏属植物为主要分类，而中国药典将其分类在麦角菌科之下。2007 年，基于多基因系统学分析的结果，科学家将冬虫夏草归到线虫草科的线虫草属。
蛹虫草是麦角菌科、虫草属的模式种，又被称为北冬虫夏草。蛹虫草在核心成分的种类上与冬虫夏草相似，其最大的优势在于很容易进行人工培育，即便是大米、小麦等基础性培养基也可顺利培育，被作为冬虫夏草的理想替代品。早在2009年，原卫生部就发布公告将蛹虫草批准为新资源食品，用于直接食用、酒类、罐头、调味品、饮料，食用量为≤2g/d；2014年，国家卫计委又发布公告，正式将蛹虫草批准为新食品原料，豁免了应用范围及用量。
蝉花是虫草科、棒束孢属真菌，也是我国的一种传统中药，其应用历史比冬虫夏草还要早几百年，早在南北朝(时期的《雷公炮炙论》就有了蝉花的加工应用记载。不过在药用方面远不及冬虫夏草，并未被《中国药典》收录。2021年1月，国家卫生健康委发布将蝉花子实体（人工培植）列为新食品原料的公告（食用量≤3g/d），从而开启了蝉花的食品应用。
广东虫草由广东省科学院广东省微生物研究所李泰辉研究员团队于2008年发表的虫草新种，隶属于真菌界、子囊菌门、盘菌亚门、粪壳菌纲、肉座菌亚纲、肉座菌目、线虫草科、弯颈霉属真菌，其活性成分要优于冬虫夏草，且安全性比冬虫夏草更好，于2013年被批准为新食品原料，食用限量为≤3g/d。
