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解锁突破性研究:2',3'-双脱氧腺苷 (ddA) 指南? 1

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简介:

什么是2',3'-双脱氧腺苷?2',3'-双脱氧腺苷(Dideoxyinosine,ddA)是一种天然核苷脱氧腺苷的合成核苷类似物。2',3'-双脱氧腺苷含有一个氢原子,而不是脱氧腺苷上的3 ' -羟基。它通过核碱基和核苷载体进入细胞,细胞酶将二脱氧腺苷转化为活性形式,二脱氧腺苷5 ' -三磷酸。这种活性代谢物通过与天然底物竞争和与病毒DNA结合,导致转录终止,对HIV-1逆转录酶有效。FDA于1991年10月首次批准使用Videx (Didanosine)。它被用作HIV-1感染联合药物治疗的一部分。最近对2',3'-双脱氧腺苷治疗的副作用、成本和复杂性的担忧导致其在一线和二线治疗方案中的使用减少。此外,在二线患者中,由于耐药介导的逆转录酶突变的流行,对2',3'-双脱氧腺苷的耐药性迅速发展。

2',3'-双脱氧腺苷是一种模仿天然DNA和RNA构建块结构的分子。这种独特的性质使ddA在研究中成为一个有价值的工具。科学家们可以利用ddA来研究各种生物过程,方法是将其纳入细胞并观察其效果。有趣的是,ddA还可以作为腺苷酸环化酶的抑制剂,腺苷酸环化酶是一种参与细胞信号传导的酶。本文深入研究ddA的世界,探索其潜力,在研究中解锁新的见解!


1. 揭秘结构:2',3'-双脱氧腺苷的化学组成

2',3'-二脱氧腺苷(ddA)具有独特的结构,这是其功能特性的基础,画出核苷 2 3 双脱氧腺苷的结构式(见下图)。它与自然产生的分子腺苷有许多相似之处,腺苷是RNA的组成部分。两者都有一个核心结构,由一个与核糖相连的融合嘌呤环系统组成。然而,一个关键的区别在于羟基的位置。

图中显示了嘌呤环、核糖以及2'和3'碳的位置,在这些位置没有羟基。其与腺苷相比,关键的区别在于在ddA中核糖的2'和3'位置没有羟基(OH)。在腺苷中,这些羟基存在,有助于分子形成磷酸二酯键,这对构建RNA链至关重要。ddA中缺乏这些羟基破坏了这一过程,使其成为DNA测序技术的宝贵工具。


2. 揭示 ddA 的力量:研究中的应用:

2.1 2',3'-双脱氧腺苷DNA测序

双脱氧核苷酸可用于DNA测序和电泳。在含有所有四种脱氧核苷酸和一个双脱氧核苷酸的混合物中进行PCR(聚合酶链反应)的DNA样品将产生长度等于该类型的每个碱基位置的链,该碱基与具有双脱氧核苷酸的类型互补。PCR中使用的taq聚合酶有利于ddGNTP,这是在各种研究中观察到的一种模式。也就是说,该特定类型的每个核苷酸碱基都有可能与脱氧核苷酸键合,而是与双脱氧核苷酸键合,从而结束链伸长。在DNA复制过程中,DNA结合到生长的DNA链中,但缺乏添加下一个核苷酸所必需的3'-羟基。这种“链终止”阻止了进一步的延伸,产生了特定长度的片段。当这些片段按大小分开时,就揭示了DNA序列。

因此,如果样品随后进行电泳,则双脱氧核苷酸补体存在的每个长度都会存在一条条带。现在通常使用荧光双脱氧核苷酸,使四种中的每一种都具有不同的荧光,可以被测序仪检测到。


2.2 ddA 作为有效的腺苷酸环化酶抑制剂:cAMP 调节

细胞通讯在很大程度上依赖于一种叫做环AMP (cAMP)的分子。腺苷酸环化酶(Adenylyl cyclase)在cAMP水平的调节中起着关键作用。以下是ddA介入的地方:

1)抑制腺苷酸环化酶: ddA作为腺苷酸环化酶的特异性抑制剂,有效减少cAMP的产生。

2)对生物过程的影响:通过控制cAMP水平,ddA可以影响各种细胞过程,如细胞生长、分化和激素作用。研究这些影响有助于研究人员了解cAMP信号通路的复杂工作原理。


2.3 超越基础:探索 ddA 的其他应用

ddA的潜力超出了DNA测序和cAMP调控。研究人员正在探索它在以下方面的应用:信号转导通路:ddA可以成为解剖细胞内复杂信号级联的有价值的工具,有助于开发针对各种疾病的靶向治疗。

凭借其独特的特性,ddA有望成为一种强大的研究工具,为解开DNA的奥秘、细胞通信等提供令人兴奋的可能性。


3. 揭示来源:哪里可以找到高质量的 2',3'-双脱氧腺苷

高质量的2',3'-二脱氧腺苷(ddA)可以从信誉良好的化学品供应商处获得。像Guideview这样的化工网可根据你的具体需求来提供合适的供应商。在选择供应商时,要考虑诸如ddA纯度等因素,这对许多研究应用至关重要。此外,实验所需的ddA数量将影响您的选择,批量购买可能会有折扣。


4. 安全有效使用的基本注意事项

使用ddA需要对安全和负责任的使用作出承诺。文献中强调在处理ddA时佩戴适当的个人防护装备(PPE)的重要性,如手套、安全眼镜和实验服,以尽量减少皮肤接触。由于其潜在的呼吸道刺激,在产生灰尘或气溶胶的过程中使用通风柜是可取的。始终在通风良好的地方处理ddA。适当的储存也很重要。将ddA保存在阴凉、干燥的地方,远离热、光和不相容的化学品。遵循这些预防措施可确保安全有效的研究环境。请记住查阅相关的安全数据表(SDS)以了解详细的处置准则,因为适当的废物管理对于保护人类健康和环境至关重要。


5. 结论:揭示 2',3'-双脱氧腺苷的潜力

2',3'-双脱氧腺苷(ddA)作为一种潜在的生物活性分子,其在抗病毒药物和生物医学研究领域具有重要意义。当前的研究已经揭示了ddA的DNA 测序和抗肿瘤潜力,并且正在进行更深入的研究以揭示其更广泛的应用。未来,随着科学技术的不断进步,ddA作为一种重要的生物活性分子,将在药物开发和生物医学研究领域展现出更广阔的应用前景,为人类健康和医学治疗带来积极的影响。


参考:

[1]https://www.dshs.wa.gov/sites/default/files/DDA/dda/documents/policy/policy6.08.pdf

[2]https://www.sciencedirect.com/topics/pharmacology-toxicology-and-pharmaceutical-science/2-3-dideoxyadenosine

[3]https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/2_3_-Dideoxyadenosine

[4]https://en.wikipedia.org/wiki/Dideoxynucleotide

[5]https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/2-3-dideoxyadenosine

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