5-甲基-2-嘧啶羧酸甲酯是一种常用的医药合成中间体。当吸入5-甲基-2-嘧啶羧酸甲酯时，应将患者转移到新鲜空气处；如果皮肤接触，应立即脱去污染的衣物，用肥皂水和清水彻底冲洗皮肤，如有不适感，应就医；如果眼睛接触，应分开眼睑，用流动清水或生理盐水冲洗，并立即就医；如果误食，应立即漱口，禁止催吐，应立即就医。
5-甲基-2-嘧啶羧酸甲酯的合成方法如下：在氩气氛下，将2-氯-5-甲基嘧啶（200mg，1.55mmol）溶解在MeOH：CH3CN（4：1，10mL）溶液中，加入Pd（dppf）（227mg，0.31mmol）、Cl2（227mg，0.31mmol）和三乙胺（0.45mL，3.11mmol），搅拌并加热至100℃，在CO压力下反应16小时。通过TLC监测反应进程，反应完成后，通过硅藻土过滤，真空浓缩滤液，得到粗产物5-甲基-2-嘧啶羧酸甲酯。通过硅胶柱色谱法使用60％EtOAc/己烷纯化粗产物，得到纯度为62％的砖红色固体5-甲基-2-嘧啶羧酸甲酯（146mg）。
1H-NMR（CDCl3，400MHz）：δ8.74（s，2H），4.08（s，3H），2.42（s，3H）；LC-MS：81.73％；153（M++1）；（柱：X桥C-18，50×3.0mm，3.5μm）；转速2.10分钟。0.05％AqTFA：ACN；0.8mL/min）；TLC：70％EtOAc/己烷（Rf：0.2）。
5-甲基-2-嘧啶羧酸甲酯在医药合成中具有广泛的应用。例如，可以通过以下反应进行转化：
在0℃下，将5-甲基嘧啶-2-羧酸酯（500mg，3.28mmol）溶解在EtOH（8mL）中，加入硼氢化钠（250mg，6.57mmol），温热至室温并搅拌4小时。通过TLC监测反应进程，反应完成后，将反应混合物稀释至水（15mL），用CH2Cl2（3×25mL）进行萃取。将合并的有机萃取液经过硫酸钠干燥、过滤和真空浓缩，得到粗产物。通过硅胶柱色谱法纯化粗产物，使用2-3％MeOH/CH2Cl2，得到纯度为59％的（5-甲基嘧啶-2-基）甲醇（240mg），为棕色固体。
1H-NMR（CDCl3，400MHz）：δ8.56（s，2H），4.80（d，2H），3.64（t，1H），2.36（s，3H）；LC-MS：92.72％；125.3（M++1）；（柱：EclipseXDBC-18，1504.6mm，5.0μm）；转速5.23分钟。0.05％AqTFA：ACN；1.0毫升/分钟）；TLC：5％MeOH/。
[1] (WO2013142269) IMIDAZOTRIAZINONE COMPOUNDS
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