青霉素钾溶解迅速，但是在养殖业中严禁静脉推注。静脉推注会导致血钾浓度升高，引起心脏骤停。此外，青霉素钾对皮肤和血管有刺激作用，推注过快会导致体内血钾过高。为了降低疼痛感，可以用苯甲醇或利多卡因稀释青霉素钾。
青霉素钠可以静脉推注和肌肉注射，但溶解相对困难。根据病情，临床上会选择使用青霉素钠。青霉素钠不适用于可能引起水肿或电解质紊乱的疾病。肾功能不良或有脑水肿的患者可以使用青霉素钾，而高血钾症患者应使用青霉素钠。
青霉素钾和青霉素钠的最大区别在于结合形式。青霉素钾结合了钾盐，青霉素钠结合了钠盐。它们的形态为白色结晶粉末，类似面粉。遇到酸或碱会迅速失效，因此使用时需要现用现兑。放置24小时后，药效会失效56%。总体来说，青霉素钾略贵于青霉素钠，但价格都相对较便宜。
青霉素钠不易溶于水，常用于注射用药。它对治疗呼吸道疾病，如支原体和肺炎，有明显效果。
青霉素钾可以迅速溶于水，因此在禽养殖中常使用。它对治疗肠炎和预防肌腺胃炎等疾病有辅助作用。此外，青霉素钾对鸡的球虫也有治疗效果。
猪、牛、羊：青霉素钠/钾可用于治疗心内膜炎、乳腺炎、肺部感染、淋巴结脓肿、子宫炎、腹膜炎、伤口感染、炭疽、恶性水肿、猪丹毒、膀胱炎、细菌性关节炎等疾病。此外，它还可用于破伤风的辅助治疗。
禽：青霉素钠/钾可用于治疗肠炎、预防肌腺胃炎、增加疫苗效果、改善鸡群状态、治疗鸡的球虫感染等。
1、青霉素不能与磺胺类药物联用，否则抗菌效果只能达到75%左右。
2、青霉素不与四环素类药物联用，否则会产生拮抗反应，影响使用效果。
3、青霉素静脉输液不与林可霉素、四环素、头孢、维生素B、C联用，混合后会产生浑浊，不宜联合使用。
4、青霉素不与氨基糖苷类药物联用，否则会使氨基糖苷类药物失去抑菌效果，因此不能混合使用。但可以分开静脉和肌肉注射使用。
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