重组质粒碱裂解过程中常常出现基因组？

如何判断是基因组呢？如果只是上样孔有没跑出来的条带有没有可能是大肠杆菌自身带的较大质粒？一般来说不会提出来用基因组，是否还有其他迹象表明有基因组存在？有基因组DNA是否对实验有影响？