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PCR条件优化?

各位朋友,新设计了引物并合成了,相关信息如图片,但是昨天
以如下程序跑PCR:
                                                                     94   2m
                                                                     94   40s
                                                                     56    1m
                                                                     72    1m
                                                                      72    10m
30个循环,退火温度跑了56度和58度的,去跑胶,内参很亮,但是56度情况下有两条带,58度一条,都模糊,想请大神们指点一二,怎么优化这个条件效果会更好,谢谢啦。


IMG_20190622_103147.jpg
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共9个回答
你想要达到什么样的效果呢?

还有,内参很亮,56℃时有两条带,是内参有两条带还是目的基因有两条带呢?
目的基因两个条带

还有,内参很亮,56℃时有两条带,是内参有两条带还是目的基因有两条带呢?

TAKARA的?你可以看一下酶的说明书。...
恩诺,好的,

我用的是E taq
...
TAKARA的?你可以看一下酶的说明书。
你做个梯度试试看,55-65℃

你想要达到什么样的效果呢?
我想找出最合适的pcr条件,后面要构建表达载体

你的退火时间和变性时间建议用一点,现在很多酶的说明书一般设为10到15s即可。延伸时间基本根据1kb/1min来设置。一般情况下,56 度或者58度,60 度都可以做的很好的。所以我觉得你应该优化你的时间,确定模板质量,酶用好的酶,其他条件没什么好优化的。
你的退火时间和变性时间建议用一点,现在很多酶的说明书一般设为10到15s即可。延伸时间基本根据1kb/1min来设置。一般情况下,56 度或者58度,60 度都可以做的很好的。所以我觉得你应该优化你的时间,确定模板质量, ...
我用的是E taq

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