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β-半乳糖苷酶催化什么反应? 1

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引言:

β-半乳糖苷酶是一种重要的酶类,在生物学和生物化学领域中具有广泛的应用。其催化特定的化学反应,对于生物体内的代谢过程和工业生产中的酶催化反应具有重要意义。本文将重点探讨β-半乳糖苷酶催化的具体反应,深入了解其催化机制和应用领域,以期为读者提供对这一酶类的全面认识,并探索其在科学研究和工业生产中的潜力。


1. β-半乳糖苷酶

β-半乳糖苷酶(EC 3.2.1.23,乳糖酶,β-半乳糖或β-半乳糖;系统名称β-D-半乳糖苷半乳糖水解酶)是一种糖苷水解酶,可催化β-D-半乳糖苷中末端非还原性β-D-半乳糖残基的水解。

β-半乳糖苷包括含有半乳糖的碳水化合物,其中糖苷键位于半乳糖分子上方。不同β-半乳糖苷酶的底物包括神经节苷脂 GM1、乳糖神经酰胺、乳糖和各种糖蛋白。


2. 了解 β-半乳糖苷酶在催化反应中的作用

糖苷水解酶家族的结构特征并不直接决定酶的立体化学催化特性,很多超家族中都同时具有保持型和反转型糖基水解酶。但同一家族的水解酶往往具有相同的催化机制。目前,普遍认为β-半乳糖苷酶采用的是保持型水解机制。催化过程如图所示。


首先,底物分子需要与酶分子对接。当底物是乳糖时,糖基部分为半乳糖基,配糖体为葡糖基 (如图中R1所代表) 。β-半乳糖苷酶具有高度底物专一性,要求底物的半乳糖基必须与多糖部分以β-糖苷键连接。但对糖苷配基的要求不是很严格,因此R1所表示的配糖体部分甚至可以是低聚糖,此时反应得到的产物即为低聚半乳糖 (GOS) 。早期研究表明β-半乳糖苷酶的结构特征对底物与酶的活性位点结合非常重要,研究报道主要集中在氢键、离子键及芳香族氨基酸侧链对底物结合的影响等方面。近年来研究发现,酶与底物结合模式,特别是结合位点氨基酸的类型与侧链性质对催化活性影响显著。其次,当底物对接到酶活性位点后,即与酶分子以共价键结合。随即半乳糖基再被转移到亲核受体上。在这步反应中,反应会根据受体的不同而发生分歧。当半乳糖基受体为水分子 (即图中R2=H) ,反应释放出半乳糖。在此情况下,乳糖或低聚糖所发生的就是水解反应,二糖或多糖被降解;当受体为另一个多糖时,反应就会朝向低聚半乳糖 (GOS) 合成的方向进行,这种情况下发生的就是转糖苷反应。目前所有关于转糖苷机制的研究报道,都是基于对糖苷水解反应做出的推测。尚不清楚当受体不同时 (比如糖类或水) ,β-半乳糖苷酶的水解活性是否发生改变。但是,不同β-半乳糖苷酶对水和糖类的选择特异性有差别,即使催化作用相同,不同酶的催化能力及产物 (水解及转糖苷产物) 组成均不相同。也有研究表明,β-半乳糖苷酶的底物特异性与活性位点氨基酸模块 (motif) 有关。


3. β-半乳糖苷酶作为选择性标记物如何发挥作用?

β-半乳糖苷酶是一种有利的工具,科学家们用它来识别那些已经成功携带了外源基因的质粒的细菌。大多数质粒载体携带一小段 lacZ 基因,其中包含 β-半乳糖苷酶前 146 个氨基酸的编码信息。β-半乳糖苷酶的基因是一种替代的选择性标记物。当外源基因插入 β-半乳糖苷酶基因中时,β-半乳糖苷酶失活。然后细菌在显色基质上生长。非重组体将产生蓝色菌落,而重组体将产生无色菌落。以下是它的工作原理:

(1)设置

科学家设计了质粒载体。 该向量包含两个关键组成部分:

β-半乳糖苷酶基因,但在其编码序列中有一个断裂(通常是插入片段)。这会破坏酶的功能,使其失去活性。


一个限制性内切酶的识别位点。这就是外源基因稍后被插入的地方。


(2)外源基因插入

目的外源基因通过限制性内切酶插入到质粒载体中。这种插入进一步破坏了被破坏的β-半乳糖苷酶基因,确保它保持无活性。


(3)培养基上的选择

含有质粒(重组和非重组)的工程细菌被放置在含有β-半乳糖苷酶显色底物的培养基上。这种底物是无色的,但当β-半乳糖苷酶作用于它时,它会变成蓝色。


(4)鉴定重组

非重组细菌:这些细菌的质粒中仍有功能性β-半乳糖苷酶基因。它们可以分解显色基质,形成蓝色菌落。


重组细菌:外源基因插入破坏了这些细菌中的β-半乳糖苷酶基因。它们不能分解基质,所以它们的菌落保持无色。


通过简单地观察菌落的颜色,科学家们可以区分携带外源基因质粒的细菌(重组菌)和没有携带外源基因质粒的细菌(非重组菌)。这使得β-半乳糖苷酶成为基因工程实验中非常方便选择的标记物。


5. β-半乳糖苷酶与什么结合?

β-半乳糖苷酶是一种主要与乳糖(一种双糖糖)结合并分解为两种单糖成分(葡萄糖和半乳糖)的酶。然而,它也可以与其他分子结合:

(1)别乳糖

这是乳糖的一种异构体,β-半乳糖苷酶实际上可以将少量乳糖转化为别乳糖。在没有乳糖的情况下,细胞产生非常低水平的 β-半乳糖苷酶、通透酶和转乙酰酶。当乳糖存在于环境中时,其异构体同种异体同种异体乳糖与lacI阻遏蛋白结合并诱导构象变化,抑制其与lac操作子区域结合的能力;这使得 RNA 聚合酶能够有效地与 lac 启动子结合并转录下游 lacZ、lacY 和 lacA 基因。


(2)其他β-半乳糖苷

这些是含有特定类型键的半乳糖的分子。例子包括一些复合糖,如神经节苷脂和乳糖神经酰胺。β-半乳糖苷酶是一种外切糖苷酶,可水解半乳糖与其有机部分之间形成的β-糖苷键。它也可以裂解岩藻苷和阿拉伯糖苷,但效率要低得多。


6. β-半乳糖苷酶是什么类型的酶?

β-半乳糖苷酶可以水解β-1,4-糖苷键,属糖苷水解酶类 (Glycoside Hydrolases,GH) ,并在进化过程中演变形成多样的底物特异性。依据蛋白质序列相似分类,β-半乳糖苷酶分别属于糖苷水解酶家族GH-1,GH-2,GH-35和GH-42,并在这些家族分布中显现出不同的催化及结构特征。如,GH-1,GH-2和GH-35家族除了β-半乳糖苷酶还包括其它糖苷水解酶类,只有GH-42家族所有成员都为β-半乳糖苷酶,而GH-2家族的β-半乳糖苷酶通常在糖苷水解和转糖苷两方面都表现出较高的活性。还有研究表明,GH-1,GH-2,GH-5,GH-10,GH-17,GH-30,GH-35,GH-39以及GH-42家族是由共同的祖先分子进化而来[7,8]。虽然,不同家族的糖苷水解酶的数量、酶学特征差别很大,但其催化构象及机制在进化过程中是却是严格保守的。


7. 常见问题解答

(1)β-半乳糖苷酶会分解 ONPG 吗?

β-半乳糖苷酶分解ONPG(邻-硝基苯-β-d-半乳糖吡喃苷)。ONPG是一种类似于乳糖的人工合成分子,但它有一个特殊的特性:

当β-半乳糖苷酶分解ONPG中的键时,它会释放两种产品:半乳糖(一种糖);邻-硝基苯酚(黄色)。

这种颜色变化使ONPG成为科学家测量β-半乳糖苷酶活性的方便工具。他们可以监测随着时间推移产生的黄色邻硝基苯酚的数量,以量化酶的活性。


(2)乳糖是 β-半乳糖苷酶的底物吗?

乳糖确实是β-半乳糖苷酶的底物。这种酶将乳糖(牛奶中的一种双糖糖)分解成两种单糖成分,半乳糖和葡萄糖。这种分解使这些简单的糖被吸收,并为身体提供能量。β-半乳糖苷酶对细菌中控制乳糖利用基因的乳糖操纵子的调节也很重要。


8. 结论:揭示β-半乳糖苷酶的机制

综上所述,β-半乳糖苷酶是一种具有重要催化功能的酶类。其在生物体内的代谢过程中起着关键作用,并在工业生产中被广泛应用于酶催化反应。通过深入了解β-半乳糖苷酶的催化机制和特性,我们可以更好地利用这一酶类的功能,推动科学研究和生产技术的发展。希望本文对读者对β-半乳糖苷酶催化的反应有所启发,并促进对这一酶类的进一步研究和应用。


参考:

[1]董艺凝,陈海琴,张灏,等. β-半乳糖苷酶的研究现状与进展 [J]. 食品与生物技术学报,2018,37 (04): 337-343.

[2]https://en.wikipedia.org/wiki/

[3]https://www.nature.com/articles/nbt0586-439

[4]https://www.nature.com/scitable/students-page/100/

[5]https://www.toppr.com/ask/question/why-is-the-coding-sequence-of-an-enzyme-beta/

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