在被毫不客气地抛弃之后，大自然又吹着胜利的号角重返化学实验室。而化学家与大自然的这种和解是否也导致了炼金术土和合成化学家相关的浮土德雄心的复苏？
19世纪的化学家们虽然也能够合成生物体中发现的物质，但是却不能在实验室中模拟生物功能，与他们不同的，今天的化学家们似乎已经踏上了去掌控和复制大自然生命过程的征程。因此，当前在理解和复制自组装机制方面的密集研究取得的成功，可以说成为了化学家和生物学家之间长久以来的敌对状态的转折点。但是，我们此时需要明白的是，对于现代化学家来说，模拟大自然不意味着复制生命。证明生命可以简化成化学力的相互作用也不再是一道难题，因而粉碎了生命是从本质上不同于非生命大自然事物的这种臆想。化学已经赢得了这场对抗的”胜利”，至少在大多数科学家心目中是这样认为的。今天，至于如何去理解地球生命演化过程中发展起来的合成策略，化学家们正在用它们作为模型来研发自己的“生物模拟”合成过程。因此，当代化学家们已经超越了最初的简单复制大自然的思维，他们现在接受并且强调生命演化中所采用的策略与他们在实验室中进行发明创造并应用于实验室的策略存在不同。
尽管方式上存在实质性的差别，但是今天的化学家们的雄心壮志仍然类似于19世纪的先驱们，他们仍希望把化学的学科疆域扩展至囊括如今属于生物学的领域。自组装和自组织之间的界限很容易发生交叉。用热力学术语来表达，自组装是由于一个密闭体系中自由能的最小化导致的过程，并最终达到一个平衡态。例如，带有疏水和亲水终端的磷脂放置在水溶液中会自发形成一个稳定的结构。而自组织则仅发生在距离平衡状态很远的开放体系中，它需要有外来能量源的输入。如果化学家可以设法控制反应的动力学以获得复杂的亚稳态结构而不是结构井然有序的物质，那么他们就可以跨越学科界限从化学领域进入到生物学领域。
弱键合力的运用以及在不同水平进行操作的能力为化学家提供了另外一种将化学扩展进入生物学领域的方式。的确，像怀特赛兹这样的化学家们已经深信，最复杂的生命现象可以完全通过化学来解释。他们断言：“细胞的本质完全属于分子问题，与生物学无关”。浮士德雄心之所以在化学家们心中重现主要还在于他们意识到，许多化学性质具有集体性或者涌现性以及理解物质总体行为的重要性。一满杯的水不同于单个的水分子，因为孤立的水分子与相互作用的水分子行为不同。让?马利?·雷恩坚持认为，这些“在一起”的分子一定是出现了新的性质，这种新的性质是结伙过程导致产生的集体行为，而非包含在每个单独的组分中的单纯的信息表达。这一基础性观察让雷恩提出了一个雄心勃勃的化学计划，对于雷恩而言，化学这门科学的终极目标是控制自组织的基础作用力。因此，他的构成动力学化学计划恢复了从19世纪开始就为人熟知的化学先驱的某些雄心，并且让人们回想起了贝特洛宏伟的合成化学计划，该计划旨在一步步引导他合成越来越复杂的化合物并最终达到对生命的合成。雷恩希望把化学重新定义为“富含信息的科学”，一门斡旋于非生命物质（物质过程）和生命物质（生物及其复杂的行为）之中的核心科学。
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