最近做DGGE,做了两三批样本。每次做,同批样本总是跑出同样的条带(一模一样)。根据我收集的资料,这几个样本的条带应该是有不同的(出现特异性条带)。大家看一下,什么原因会导致这种情况啊?
我初步的分析是:1.污染(但我真怀疑每次污染都一模一样,太巧了)
2.可能每个条带代表多种细菌,将条带回收测序结果可能包含自己想要的特异性细菌。
大家怎么认为,帮我分析一下原因吧。多谢!