酶基因克隆的问题？

筛选到一株产酶菌株，经鉴定未找到genebank上有关该菌株此酶基因序列，已查到的一些其他菌种产生该酶的基因信息，设计引物时引物的模板该如何选择呢，还有如果我用已经公开的其他菌种的酶基因设计引物，并且能够扩增我的样品，是不是扩增得到的序列不能确定就是全序列呢，这种情况下应该怎么获得该酶的基因信息呢，还望高手指导