在药物开发过程中,优化化合物的吸收、分布、代谢、排泄(ADME)性质是非常关键的。据统计超过80%的新化合物在新药研究的后期被淘汰,有一半是由于ADME性质不符合要求。ADME Suite软件提供预测化合物ADME性质的功能,能够在药物研发的早期阶段对化合物的ADME性质进行预测,可以显著降低药物研发的费用,同时节省候选药物研发和评估的时间。
采用ADME Suite,您只需要输入候选化合物的二维结构,ADME Suite就能为您自动预测出该化合物的各种ADME性质,如下:
1. Passive Absorption:精确预测被动肠内吸收、caco-2体外模型、透皮吸收、口服吸收。
2. Oral Bioavailability:口服生物利用度。
3. P-gp Specificity:计算化合物作为P-glycoprotein底物抑制剂的可能性。
4. Blood-Brain Barrier Permeation:预测血脑屏障通透(LogPS)。
5. Ionization:预测acid pKa、base pKa,计算LogD
6. Absolv Absolv模块通过Prof M.H. Abraham 提出的Abraham方程来计算溶剂相关性质。
可以预测Abraham溶剂化参数以及每个原子对参数的贡献。
l H-binding acidity and basicity parameters(A、B and B0)
l gas phase-hexadecane partitioning coefficient(L)
l polarity/polarizability parameter(S)
l Excessive molar refraction(E)
l McGowan volume(V)
7. Distribution:预测化合物的血浆蛋白结合率、血清白蛋白的平衡结合常数、以及表观分布容积。
8. PK Explorer:用来搜索化合物的口服生物利用度、血浆药物浓度、等药代动力学的相关性质。PK Explorer可以模拟血浆药物浓度随时间变化的关系。
9. P450 Inhibitior:ADME Suite可以预测化合物对五种P450酶(CYP3A4,CYP2D6,CYP2C9,CYP2C19,CYP1A2)的抑制作用。该模块训练集超过69,000多个化合物。
10. PhysChem:计算化合物在纯水,以及在不同生理pH条件下的溶解度,定性判断化合物的溶解性。计算化合物的pKa,logD,logP值。计算化合物的氢键给体数目,氢键受体数目,可旋转键的数目,TPSA。
11. ADME Suite的扩展功能。对于P-gp Specificity、Distribution、P450 Inhibitors、Solubility、logD、logP、pKa模块,可以自扩充训练集,提高计算结果的可靠性。