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什么是CAY10603的生物活性?如何进行实验? 1

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首先,让我们了解一下CAY10603的生物活性:

1)体外活性
CAY10603(化合物7)对胰腺癌细胞系BxPC-3,HupT3,Mia Paca-2,Panc 04.03和SU 86.86表现出有效的抑制活性,其IC50值分别为1, 0.3, 0.1, 0.1, 0.6,和<0.5μM。此外,CAY10603还抑制了HDAC6的脱乙酰酶活性,并抑制了肺腺癌细胞的增殖。它还能诱导肺腺癌细胞的凋亡。与吉非替尼联合使用时,CAY10603能够协同诱导肺腺癌细胞的凋亡,部分原因是通过去稳定化EGFR和失活EGFR通路[2]。

接下来,我们将介绍如何进行CAY10603的活性实验。一般来说,有以下两种方法:

1)细胞实验
从ATCC获得胰腺癌细胞系BxPc-3,HupT3,Mia Paca-2,Panc 04.03和SU 86.86,并在含有10%胎牛血清和1-谷氨酰胺的培养基(DMEM或RPMI)中培养。将胰腺癌细胞分别铺在96孔微量滴定板的6个孔中,每孔2.5-4P103个细胞。接种后4小时,用稀释剂(DMSO)或不同浓度的SAHA或指定的HDACI处理各孔,浓度范围为1nm至50mm。在处理后72小时,使用MTT比色法测量细胞毒性。使用XLfit计算IC50值。

2)激酶实验
CAY10603(化合物7)对胰腺癌细胞系BxPC-3,HupT3,Mia Paca-2,Panc 04.03和SU 86.86表现出有效的抑制活性,其IC50值分别为1, 0.3, 0.1, 0.1, 0.6,和<0.5μM。此外,CAY10603还抑制了HDAC6的脱乙酰酶活性,并抑制了肺腺癌细胞的增殖。CAY10603还能诱导肺腺癌细胞的凋亡。与吉非替尼联合使用时,CAY10603能够协同诱导肺腺癌细胞的凋亡,部分原因是通过去稳定化EGFR和失活EGFR通路[2]。

HDAC抑制测定:将纯化的HDAC与1mM羧基荧光素(FAM)标记的乙酰化肽底物和测试化合物在25℃下在含有100mM HEPES(pH 7.5),25mM KCl,0.1%BSA的HDAC测定缓冲液中孵育17小时。和0.01%Triton X-100。通过加入含有0.078%SDS的缓冲液终止反应,最终SDS浓度为0.05%。使用Caliper LabChip 3000系统的蓝色激光激发和绿色荧光检测(CCD2)电泳分离底物和产物。使用Caliper系统上的Well Analyzer软件测定底物中的荧光强度和产物峰。对于每个样品,反应一式两份进行。使用IDBS XLFit版本4.2.1插件和XLFit 4参数逻辑模型自动计算IC50值:((A +((B_A)/ 1 +((C / x)D))),其中x是化合物浓度,A和B分别是估计的抑制百分比的最小值和最大值,C是拐点,D是S形曲线的Hill斜率。使用IDBS XLFit版本4.2.1插件和公式xf4_FitResultStdError自动计算IC50值的标准误差。

通过以上介绍,我们了解了CAY10603的生物活性和实验方法。综上所述,CAY10603是一种有效的选择性HDAC6抑制剂,其靶点活性为HDAC1(271nM)和HDAC6(2pm)。
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