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粪便DNA提取试剂盒的应用及其优势? 1

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背景信息

粪便DNA提取试剂盒是一种用于从粪便样本中提取人类和肠道菌群基因组DNA的高效工具。该试剂盒采用超顺磁性微球进行提取,可直接使用预制的缓冲液进行样本提取,并根据样本量进行反应体系的调整。

粪便样本中含有大量有意义的基因组DNA,其中包括动物自身脱落的消化道细胞、各种细菌和真菌等微生物以及未消化食物的DNA。然而,由于粪便中存在大量抑制因子,常规的DNA纯化方法无法有效去除这些杂质,导致下游实验的失败,如PCR扩增无法成功。

粪便DNA提取试剂盒可手动操作,也适用于自动化工作站进行高通量操作。提取的产物可用于PCR扩增、测序等后续实验。

产品特性

1. 提供自动化解决方案,适用于200μl-10ml体积的样品。

2. 高提取量:200mg样本提取量大于2μg。

3. 试剂盒具有良好的稳定性。

4. 试剂不含有毒溶剂如酚和氯仿。

粪便DNA提取试剂盒的应用

松辽黑猪肠道内容物及粪便总DNA提取方法对比研究及其盲肠微生物多样性分析研究

长期低剂量使用抗生素可以降低断奶后仔猪的应激反应和腹泻率,提高生产效率。然而,抗生素的长期使用也存在潜在的危害,如抗生素残留和对肠道菌群及宿主健康的负面影响。因此,开发抗生素替代物具有重要意义。

无论是抗生素还是抗生素替代物,肠道微生物都是其重要的作用靶点。评价抗生素替代物对肠道微生物的影响是其中的重要指标之一。肠道微生物种类繁多,肠道内容物组成复杂。

总DNA的提取对于研究肠道微生物群落结构变化和肠道微生物多样性分析等具有重要意义。因此,在利用各种分子生物学技术研究肠道微生物时,首先需要选择一种适合的总DNA提取方法。

研究比较了5种不同的提取方法对松辽黑猪仔猪盲肠内容物和粪便中总DNA的提取效果。

研究结果表明:QIAamp DNA Stool Mini Kit提取得到的DNA纯度、得率和所反映的微生物多样性最高,更适合用于松辽黑猪盲肠内容物和粪便中总DNA提取及其微生物多样性分析。TIANamp Stool DNA Kit和SDS高盐提取法提取得到的DNA纯度、得率和所反映的微生物多样性较低;索莱宝粪便基因组DNA提取试剂盒和TZ裂解液提取法提取得到的DNA纯度和得率最差,微生物多样性最低,不适合用于肠道微生物总DNA提取。

参考文献

[1] The pig gut microbial diversity: Understanding the pig gut microbial ecology through the next generation high throughput sequencing. Hyeun Bum Kim, Richard E. Isaacson. Veterinary Microbiology. 2015(3-4).

[2] Early-life establishment of the swine gut microbiome and impact on host phenotypes. Núria Mach, Mustapha Berri, Jordi Estellé, Florence Levenez, Ga?tan Lemonnier, Catherine Denis, Jean-Jacques Leplat, Claire Chevaleyre, Yvon Billon, Jo?l Doré, Claire Rogel-Gaillard, Patricia Lepage. Environmental Microbiology Reports. 2015(3).

[3] Comparison of direct boiling method with commercial kits for extracting fecal microbiome DNA by Illumina sequencing of 16S rRNA tags. Xin Peng, Ke-Qiang Yu, Guan-Hua Deng, Yun-Xia Jiang, Yu Wang, Guo-Xia Zhang, Hong-Wei Zhou. Journal of Microbiological Methods. 2013(3).

[4] A comparison of the efficiency of five different commercial DNA extraction kits for extraction of DNA from faecal samples. Shantelle Claassen, Elloise du Toit, Mamadou Kaba, Clinton Moodley, Heather J. Zar, Mark P. Nicol. Journal of Microbiological Methods. 2013(2).

[5] 孙盛. 松辽黑猪肠道内容物及粪便总DNA提取方法对比研究及其盲肠微生物多样性分析[D]. 吉林大学, 2016.

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